Santé et microbiotes, question d'équilibre ! (2/5)

Avec la pléthore d’ouvrages et d’études scientifiques qui lui sont consacrés chaque année, on peut dire que le microbiote intestinal est aujourd’hui au centre de toutes les attentions de la recherche médicale. Logé tout au long du tube digestif, il est constitué de virus, parasites, levures, mais surtout de bactéries (100 000 ­milliards, soit dix fois plus que le nombre de cellules de notre corps) !

Grâce à la métagénomique qui « photographie » la composition du microbiote, la recherche médicale dénombre aujourd’hui plus de mille espèces de bactéries différentes dont les principales se nomment firmicutes (incluant notamment les genres Ruminococcus, Clostridium et Lactobacillus) et les Bacteroidetes (Bacteroides, Prevotella et Xylanibacter). « Bien que certaines espèces “fondatrices” comme Faecalibacterium prausnitzii ou Akkermansia muciniphila soient présentes chez la majorité d’entre nous, chacun possède une identité microbiotique aussi unique que nos empreintes digitales », explique Marion Kaplan, naturopathe et coauteure de Power biotique. Mais pourquoi ce nid à microbes fascine-t-il autant les chercheurs ? Pour la simple et bonne raison qu’il est en étroite relation avec notre santé. Certes, il participe à notre digestion, mais la science démontre son large rôle dans la maturation du système immunitaire et la lutte contre les pathogènes, le développement du système nerveux central, la régulation de l’inflammation ou encore la régulation de la santé mentale.

Cependant, à l’image des écosystèmes de notre environnement, celui qui se cache dans nos intestins demeure fragile. « Des déséquilibres entre bonnes et mauvaises bactéries peuvent ­facilement survenir et se traduisent par une perte de quantité et de diversité microbienne » explique Didier Chos, médecin spécialiste en micronutrition et consultant chez le laboratoire Pilèje. Ainsi, chez des patients atteints de maladie inflammatoire chronique (Mici), on détecte une surabondance d’entérobactéries (E. Coli) et une diminution de bactéries aux effets anti-inflammatoires comme Faecalibacterium prausnitzii. Ces états de dysbiose, souvent associés à une perte d’étanchéité de la paroi intestinale, sont en lien avec de nombreuses maladies : allergies, obésité, Alzheimer, diabète, dépression, etc.

Mais alors, comment savoir si votre flore est équilibrée ? Selon Éric Lorrain, médecin phytothérapeute et auteur de l’ouvrage La phyto, ma médecine au naturel (éd. Dunod) : « Il faut questionner l’intestin et le mode de vie de l’individu » pour déceler l’origine d’une éventuelle dysbiose. Fréquence des selles ? Mastication ? Pratique du sport ? Intolérances alimentaires ? Régimes ? Prise de médicaments ? Voyage récent ?... En complément de l’enquête, des analyses de selles plus ou moins poussées peuvent orienter la stratégie thérapeutique. « Un examen mycobactériologique classique (remboursé), ou un fécalogramme (non remboursé) en laboratoire spécialisé vont préciser la composition du microbiote » explique le médecin.

Mais pas besoin d’attendre ces résultats pour adopter une hygiène de vie préventive, tirée des enseignements de chercheurs et biologistes ! Pour commencer, l’alimentation exerce une forte influence sur la richesse et la diversité de nos microbes. Et si, dans l’absolu, un régime adapté aux spécificités de votre microbiote serait l’idéal, certains conseils pourraient bien vous convenir. « Le secret d’un microbiote sain réside dans la diversité de notre apport alimentaire, explique Marion Kaplan. Nos bactéries apprécient particulièrement la nourriture contenant des fibres prébiotiques qui favorisent la production de substances tels que les acides gras à courte chaîne. À l’instar du butyrate, ils leur servent de carburant ». Où trouver des fibres prébiotique ? Mangez topinambour, artichaut, aubergine, courgette ; pommes, bananes, agrumes ; céréales complètes, sans oublier les légumineuses. Enfin, faites la part belle aux aliments fermentés comme le kéfir de fruits et la choucroute. Aromatisez le tout d’anis, de cumin et de fenouil aux vertus carminatives, vos bactéries vous remercieront pour le festin ! « Le pissenlit, la piloselle et la chicorée ont aussi un effet prébiotique et sont utiles en cas de ballonnements, spasmes et constipation » précise Éric Lorrain.

Par ailleurs, si vous vous posez la question de recourir ou non aux produits laitiers, ces derniers, selon les marques, apportent des bactéries Lactobacillus bulgaricus et Streptococcus thermophilus intéressantes contre la constipation. Selon Didier Chos : « S’il n’y a pas d’intolérance au lactose ou à la caséine, on peut en consommer sans en abuser ! ». En complément de ces mesures diététiques, on soutient la fonction intestinale avec des vitamines (A, B1, B9 et D) ainsi que des nutriments capables de réduire l’hyperperméabilité intestinale. « L’acide aminé L-glutamine, le zinc ou les polyphénols contenus dans le raisin ont un effet cicatrisant, en complément d’un probiotique adapté », conseille Didier Chos.

Les probiotiques vont éviter le développement de germes pathogènes et ont démontré leur utilité sur de nombreuses pathologies en lien avec une dysbiose. Mais là encore, la difficulté est de trouver les souches qui nous correspondent. Dans ce cas, Éric Lorrain recommande les probiotiques « à large spectre », avec un minimum de 10 milliards de bactéries par gélules. « Lactibiane Référence convient dans de nombreux tableaux cliniques car il est à la fois immunostimulant, rééquilibrant et anti-­ballonnements ».

En phytothérapie, le Dr Lorrain conseille de nettoyer les intestins au printemps et/ou à l’automne avec des extraits de plantes standardisés (EPS) de mélisse antispasmodique, de fumeterre activatrice des sécrétions digestives et de pissenlit à l’effet prébiotique. « Demandez en pharmacie un mélange à parts égales des trois plantes dans un flacon de 300 ml. Sur 6 jours, prenez une cuillère à soupe du mélange 5 fois par jour ». Pour des cas de dysbiose accompagnée de diarrhées, l’extrait de noyer antiseptique, antidiarrhéique et protecteur hépatique en association avec la réglisse réparatrice de la muqueuse, et le curcuma anti-­inflammatoire, sont adaptés. « Prenez 5 ml d’un mélange à parts égales de ces trois plantes en EPS pour un flacon de 150 ml, deux à trois fois par jour au moment des repas avec de l’eau, pendant 1 mois ». Dans le cas d’une dysbiose liée à une baisse d’immunité, miser sur l’EPS d’échinacée. « Cette plante renforce l’immunité locale. En cas de maladie auto-immune, on ajoute des EPS de réglisse et curcuma, en mélange à parts égales avec les mêmes posologies que pour la dysbiose avec diarrhée », recommande le Docteur Éric Lorrain.

Sachez que les huiles essentielles riches en phénols exercent une action rééquilibrante de la flore en ­écrêtant les souches ayant ­anormalement pullulé. La cannelle de Ceylan, l’origan vulgaire, le thym à thymol ou encore le clou de girofle pénètrent dans la matrice des jeunes bactéries pour les détruire. « On peut les consommer par voie orale en ­capsules pour désinfecter l’intestin » explique le Dr Lorrain. Gare toutefois, à ne pas les utiliser plus de trois semaines, au risque de fragiliser votre muqueuse intestinale. Enfin, sachez qu’il n’est pas bon de négliger l’activité physique. Des études récentes ont montré que la pratique d’une activité sportive d’endurance de trente à soixante minutes trois fois par semaine induit des changements significatifs du microbiote intestinal, notamment sur les bactéries en lien avec les états de dépression et d’anxiété.

Le microbiote vieillit-il ?

Prendre de l’âge n’est pas anodin pour le microbiote. Il se trouve appauvri par les changements physiologiques, une alimentation moins variée, la prise de médicaments et l’absence d’activité physique. Les études ont indiqué que les bactéries non-dominantes – entérocoques, streptocoques mais surtout entérobactéries – augmentent chez les sujets âgés. Ceux qui résident en maison de retraite auraient un appauvrissement de leur microbiote plus marqué que ceux qui restent à domicile avec leur régime alimentaire habituel. « Il faut prendre de la chicorée au petit-déjeuner, un puissant prébiotique et, bien-sûr, des probiotiques » précise le Dr Lorrain. Une étude récente montre une corrélation négative entre le nombre de médicaments consommés et la diversité du microbiote intestinal chez les sujets âgés : inhibiteurs de la pompe à protons, antidépresseurs et antipsychotiques augmentent certaines espèces microbiennes.